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Le report de la deuxième dose des vaccins contre la COVID-19 devrait réduire le nombre de cas à court terme; à long terme, cependant, le nombre de cas et le risque d’évolution du virus vers l’évasion immunitaire seront fonction de la vigueur de la réaction immunitaire que provoque l’infection elle-même et le vaccin après une ou deux doses. C’est ce qui ressort d’une étude de l’Université McGill et de l’Université de Princeton, publiée récemment dans la revue Science.

« Plusieurs pays, dont le Royaume-Uni et le Canada, ont décidé de reporter l’administration de la deuxième dose des vaccins contre la COVID-19 en raison des problèmes d’approvisionnement, mais aussi dans le but de vacciner rapidement le plus de personnes possible », explique l’auteur principal de l’étude, , étudiant aux cycles supérieurs dans les départements d’écologie et de biologie évolutive, ainsi que de biologie quantitative et de bio-informatique, à l’Institut Lewis-Sigler de l’Université de Princeton.

« Si l’on en juge par les premiers essais cliniques sur les vaccins et les données épidémiologiques qui ont suivi, la première dose est très efficace. Mais à ce stade-ci, on ignore pendant combien de temps l’immunité conférée par cette première dose (voire par les deux doses ou par l’infection naturelle, d’ailleurs) va demeurer efficace », poursuit Chadi Saad-Roy.

À l’aide d’un modèle simple, et à partir de divers schémas vaccinaux et de diverses hypothèses sur la réaction immunitaire, les chercheurs ont fait des projections sur l’incidence de la COVID-19 et sur le degré d’immunité de la population. En raison des incertitudes immunologiques et épidémiologiques qui planent sur ces résultats, nous devons absolument avoir recours à des modèles simples pour nous projeter dans l’avenir », précise Caroline Wagner, professeure adjointe au Département de bio-ingénierie de l’Université McGill et auteure en chef de l’article.

Une seule dose n'est pas toujours suffisante

Comme on s’y attendait, l’étude a confirmé que le report de la deuxième dose pourrait réduire le nombre de cas à court terme en immunisant plus rapidement une population plus vaste. Toutefois, si cette première dose déclenche une réaction immunitaire moins vigoureuse, les vagues subséquentes pourraient frapper plus fort.

« Cela dit, au fur et à mesure que notre capacité vaccinale augmentera, nous pourrons accélérer la vaccination ou nous rapprocher du schéma de deux doses recommandé, si bien que ces effets épidémiologiques à long terme seront sans doute moins marqués; c’est un paramètre important pour le travail de planification des autorités de santé publique », ajoute la P^re Wagner.

Autre conséquence non négligeable des réactions immunitaires partielles : la possibilité que le virus échappe à l’offensive immunitaire. Pour s’attaquer à ce problème complexe, les auteurs ont adapté un modèle « phylodynamique » simple d’évasion immunitaire élaboré antérieurement par trois d’entre eux, à savoir , et , en collaboration avec d’autres collègues. Cette théorie veut que chez un sujet partiellement immunisé, le virus puisse évoluer en présence d’une pression de sélection modérée et d’une transmission virale suffisante. Ici, les auteurs étudient cette possibilité ainsi qu’une série d’autres scénarios, dont un – plus optimiste – où le potentiel d’adaptation serait minime chez un hôte dont l’immunité est en déclin après une ou deux doses de vaccin.

« Déjà, au moins un variant qui pourrait échapper partiellement au système immunitaire est en circulation, souligne Edward Holmes. La simple théorie nous enseigne que l’hôte qui présente une immunité intermédiaire pourrait jouer un rôle important dans l’évolution et la transmission des variants. C’est pourquoi la vigueur et la durée de l’immunité, et surtout leur effet sur la retransmission, sont ici des paramètres de première importance », précise Bryan Grenfell.

³¢'é³Ù³Ü»å±ð souligne une constatation intuitive : les très faibles taux d'administration du vaccin peuvent être associés à un nombre de cas plus important et, éventuellement, à un potentiel d'adaptation virale plus élevé. « Cela souligne l'importance d'une distribution équitable des vaccins au niveau mondial, car une fuite immunitaire dans un endroit se propage rapidement », explique C. Jessica E. Metcalf, co-autrice de l'article, professeure agrégée à l'EEB et à l'École des affaires publiques et internationales de Princeton et membre associé du corps enseignant du High Meadows Environmental Institute.

« Les modèles sont relativement simples d'un point de vue conceptuel, mais ils illustrent la complexité du problème et soulignent les défis auxquels nous sommes encore confrontés », note Michael Boots, professeur de biologie intégrative à l'UC Berkeley, qui n'a pas contribué à la présente étude. « Ce travail important fournit un cadre que nous pouvons utiliser pour guider notre approche à l'avenir et identifie en outre les principales lacunes en matière de connaissances que nous devons combler » ajoute-t-il.

L’Université McGill

Fondée en 1821 à Montréal, au Québec, l’Université McGill figure au premier rang des universités canadiennes offrant des programmes de médecine et de doctorat. Année après année, elle se classe parmi les meilleures universités au Canada et dans le monde. Établissement d’enseignement supérieur renommé partout dans le monde, l’Université McGill exerce ses activités de recherche dans deux campus, 11 facultés et 13 écoles professionnelles; elle compte 300 programmes d’études et au-delà de 40 000 étudiants, dont plus de 10 200 aux cycles supérieurs. Elle accueille des étudiants originaires de plus de 150 pays, ses 12 800 étudiants internationaux représentant 31 % de sa population étudiante. Au-delà de la moitié des étudiants de l’Université McGill ont une langue maternelle autre que l’anglais, et environ 19 % sont francophones.

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