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Pour assembler un casse-t锚te, il faut reconna卯tre la forme et le dessin de ses pi猫ces et agencer ces derni猫res en respectant un ordre particulier. Un peu de la m锚me fa莽on, des chercheurs de l鈥橴niversit茅听McGill ont d茅couvert que la forme tridimensionnelle du g茅nome d鈥檜ne cellule leuc茅mique constitue l鈥檜ne des cl茅s permettant de r茅soudre le casse-t锚te de la classification des maladies chez l鈥檋omme. Les r茅sultats de leurs travaux ont fait l鈥檕bjet d鈥檜n article publi茅 dans la revue scientifique en libre acc猫s Genome Biology.

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Jos茅e听Dostie, professeure et chercheuse au D茅partement de biochimie de la Facult茅 de m茅decine de l鈥橴niversit茅 McGill, a ax茅 ses travaux sur la forme cr茅茅e par la r茅gion couvrant les g猫nes de la bo卯te hom茅otique听A (HOXA) dans les cellules humaines听鈥捥齯n groupe de 11听g猫nes codant pour des prot茅ines fortement incrimin茅es dans de nombreux types de cancer. La professeure听Dostie et ses coll猫gues ont d茅couvert que la forme de cette r茅gion 驳茅苍辞尘颈辩耻别 constituait un excellent indicateur du sous-type de leuc茅mie en cause. Ces r茅sultats pr茅liminaires sugg猫rent que la 驳茅苍辞尘颈辩耻别 tridimensionnelle pourrait permettre une personnalisation optimale du traitement, bien que les applications cliniques de cette d茅couverte soient encore loin. 听
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芦听Je m鈥檌nt茅resse au r么le du repliement du g茅nome dans la sant茅 et les maladies humaines听禄, affirme la professeure听Dostie, qui est 茅galement chercheuse au Centre de recherche sur le cancer Goodman. 芦听Mon approche repose sur des technologies qui permettent de d茅terminer la position respective de chaque morceau d鈥橝DN par rapport aux autres, de sorte que nous pouvons reconstruire la structure tridimensionnelle du g茅nome en r茅unissant les divers 茅l茅ments d鈥檌nformation, comme s鈥檌l s鈥檃gissait des pi猫ces d鈥檜n casse-t锚te.听禄听
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La professeure听Dostie et les membres de son 茅quipe听鈥捥齮ous de l鈥橴niversit茅 McGill听鈥� 茅tudient l鈥檕rganisation du g茅nome dans son ensemble et celle de r茅gions pr茅cises intervenant dans les maladies humaines. Le groupe de g猫nes HOXA est l鈥檜ne des r茅gions qui pr茅sentent des anomalies de r茅gulation dans de nombreux types de cancer.
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芦听Des 茅tudes pr茅c茅dentes avaient permis de montrer que l鈥檈xpression g茅n茅tique 鈥� les prot茅ines sp茅cifiques produites par les g猫nes听鈥捥齝onstituait un excellent facteur pr茅dictif de la pr茅sence de leuc茅mie chez un patient听禄, affirme le professeur Mathieu听Blanchette, coauteur de l鈥櫭﹖ude et professeur adjoint 脿 l鈥櫭塩ole d鈥檌nformatique de l鈥橴niversit茅听McGill. 芦听Nous avons d茅couvert que divers types de cellules leuc茅miques pr茅sentent 茅galement une interaction distinctive avec la chromatine听鈥捥齭oit le mode de pliage de la chromatine qui compose le g茅nome.听禄 On ignore encore si la forme du g茅nome joue un r么le dans l鈥檃pparition du cancer, ou si c鈥檈st le cancer lui-m锚me qui en modifie la morphologie. Des 茅tudes plus pouss茅es devront 锚tre r茅alis茅es afin de d茅terminer si la forme du g茅nome constitue un bon indicateur d鈥檃utres types de cancer.听禄
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芦听Notre 茅tude vient confirmer une nouvelle piste de recherche听: l鈥檃pplication de la 驳茅苍辞尘颈辩耻别 tridimensionnelle pour l鈥櫭﹖ablissement de diagnostics ou de traitements m茅dicaux pouvant 锚tre utilis茅s dans le cas de maladies pour lesquelles les technologies actuelles, y compris les donn茅es sur l鈥檈xpression g茅n茅tique, ne permettent pas d鈥檃m茅liorer les soins prodigu茅s aux patients听禄, affirme la professeure听Dostie. 芦听Si le recours 脿 la 驳茅苍辞尘颈辩耻别 tridimensionnelle en pratique clinique demeure un objectif lointain compte tenu des d茅fis techniques auxquels nous devrons faire face pour que les fruits de la recherche se traduisent en traitements concrets, nous avons n茅anmoins d茅couvert une nouvelle fa莽on d鈥檃border la classification des maladies qui doit faire l鈥檕bjet d鈥櫭﹖udes plus pouss茅es, ne serait-ce que pour l鈥檌nformation qui en d茅coulerait sur le fonctionnement du g茅nome humain.听禄听
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鈥淐lassifying leukemia types with chromatin conformation data鈥�

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